个人简介
葛芹玉，男，1978年11月生，工学博士，副教授，博士生导师，博士后合作导师。中国电子学会生物医学电子学分会委员；江苏省研究型医院学会白血病专委会常任委员；江苏省免疫学会转化医学专委会委员。
每年招收博士研究生1名，硕士研究生1-3名，欢迎生物医学工程相关专业及具有生物、医学、统计背景的同学报考。Email：geqinyu@seu.edu.cn。
个人网站链接：https://www.x-mol.com/groups/qinyu_ge
研究方向：高通量测序技术及其应用研究
微量核酸样本的处理、扩增及测序技术研究
单细胞空间组学技术及应用研究
游离核酸与无创植入前诊断、肿瘤检测、环境检测等
研究成果
近年来主要围绕组学数据的获取与分析应用开展工作。主要包括各类生物样本前处理、核酸扩增、测序文库构建及测序数据分析及在游离核酸中的应用。主持完成国家自然科学基金项目2项、国家重点研发计划课题1项、教育部、江苏省等省部级项目4项；作为学术骨干人员参与多项国家自然基金重点项目、863重大仪器专项、国家重点研发计划和国家重大仪器研制专项等国家级重要科研项目。相关研究结果已经发表SCI论文百余篇，其中以第一作者/通讯作者在Analytical Chemistry、Biosensor & Bioelectronics、Analytica Chimica Acta、ACS AMI、Briefings in bioinformatics、IJBS等杂志发表学术论文60余篇，他引超2400次，单篇最高他引超340次。荣获教育部自然科学二等奖一项。
近期部分代表性论文
1. Yng Zhou, Ting Qi, Min Pan, Jing Tu, Zhao XW, Ge QY*. Deep-Cloud: A Deep Neural Network-Based Approach for Analyzing Differentially Expressed Genes of RNA-seq Data. J. Chem. Inf. Model. 2023. https://pubs.acs.org/doi/10.1021/acs.jcim.3c00766. [基于神经网络的差异表达分析方法]
2. Erteng Jia, Yuqi Sheng, Huajuan Shi, Ying Wang, Ying Zhou, Zhiyu Liu, Ting Qi, Min Pan,Yunfei Bai, Xiangwei Zhao,* and Qinyu Ge,*Spatial Transcriptome Profiling of Mouse Hippocampal Single Cell Microzone in Parkinson’s Disease. Int. J. Mol. Sci. 2023, 24, 1810. https://doi.org/10.3390/ijms2403181 [空间转录组技术应用于帕金森病模型鼠的研究]
3. Huajuan Shi, Min Pan, Erteng Jia, Wenxiang Lu, Ying Zhou, Yuqi Sheng, Xiangwei Zhao, Lingbo Cai* and Qinyu Ge*. A comprehensive characterization of cell-free RNA in spent blastocyst medium and quality prediction for blastocyst. Clinical Science. 2023, 00 1-14. https://doi.org/10.1042/CS20220495[胚胎培养液cfRNA用于胚胎质量评估的研究]
4. Yuwei Yang, Zhiyu Liu, Junru Lu, Yuqing Sun, Yue Fu, Min Pan, Xueying Xie & Qinyu Ge*. Analysis approaches for the identification and prediction of N6-methyladenosine sites. Epigenetics. 2023, https://doi.org/10.1080/15592294.2022.2158284. [m6A甲基化位点鉴定及预测方法总结]
5. Ying Zhou, Erteng Jia,Yuqi Sheng, Yi Qiao, Ying Wang, Huajuan Shi, Zhiyu Liu, Min Pan, Jing Tu, Yunfei Bai, Xiangwei Zhao*, Qinyu Ge*, Zuhong Lu. Sensitive and Low-Bias Transcriptome Sequencing Using Agarose PCR. ACS Applied Materials & Interfaces. 2022, 14, 19154-19167. https://doi.org/10.1021/acsami.2c02133. [高效琼脂糖PCR扩增技术应用于空间转录组测序研究]
6. Jia ET; Shi HJ; Wang Y; Zhou Y; Ge QY*. Optimization of library preparation based on SMART for ultralow RNA-seq in mice brain tissues. BMC Genomics, 2021, 22: 809. https://doi.org/10.1186/s12864-021-08132-w. [超微量RNA转录组测序建库技术研究]
7. Shi HJ; Zhou Y; Jia ET; Liu ZY; Pan M; Bai YF; Zhao XW; Ge QY*. Comparative analysis of circular RNA enrichment methods. RNA Biology, 2021, https://doi.org/10.1080/15476286.2021.2012632. [CircRNA富集方法测序比较]
8. Jia, ET; Zhou, Y; Shi, HJ; Pan, M; Zhao, XW; Ge, QY*. Effects of brain tissue section processing and storage time on gene expression. Analytica Chimica Acta. 2021, 1142: 38-47. https://doi.org/10.1016/j.aca.2020.10.046. [组织样本存放时间对RNA完整性及基因表达的影响]
近期承担/参与的科研项目
1. 深圳科技计划项目，JCYJ20230807114612024，基于微阵列的全称空间转录组测序方法及其应用方法。
2. 国家重点研发计划，2022YFF0710804，重大呼吸慢病动物模型生物样本库和多模分析数据库建立。
3. 江苏省自然基金面上项目, BK20201148, 胎儿DNA富集方法及其在无创产前中的应用。
4. 国家重大科研仪器研制项目, 81827901, 基于形态与组学空间信息的细胞分型全脑测绘系统。